浮游菌采样器是一种高效的多孔吸入式尘菌采样器。它根据颗粒撞击原理和等速采样理论设计，采样直接，采样口风速与洁净室内风速基本相同，能更准确地反映洁净室内的微生物浓度。
采样时，带尘菌空气高速通过微孔，被撞击在培养皿内的琼脂表面；这些活体微生物在培养过程中，发生动态再水化过程，高速生长，从而更快得出结果。
以微孔撞击式为例，依据Anderson(安德森)原理，浮游菌采样器通过泵的抽气，使空气中的颗粒以一定的流速进入采样器。
只有流速乘以颗粒的质量得到的值，也就是颗粒的动量，大于培养基表面的气垫阻力乘以受阻的时间所得到的值时，该微生物颗粒可以被吸附在培养基上。否则，该颗粒将通过浮游菌采样器的旋风分流装置排出，而不能够被培养皿捕获。
因此，气体的流速这一参数是采样过程的关键，其大小直接影响到在一定时间内培养皿中所能采集到空气微生物颗粒的数量。
在仪器结构不被破坏的情况下，一般认为空气的横截面积是恒定的，流量与流速是成线性正比的关系。因此，采用测定流量值的方法间接反映流速的大小是合理的。
